1С:Документооборот.

Почему у пользователя при сортировке по исполнителям у Иванова может появится активный сотрудник Губанов на форме задачи мне?

Замещения и помощников среди них нет в одном подразделении, у других подразделений нет таких проблем.

Иванова начальник.
Губанова подчинённый.

(0) какая версия ДО? В 2.1 я бы посмотрел дескрипторы доступов к этим задачам и проверил, по каким правилам они назначены.

(1) Документооборот КОРП, редакция 3.0 (3.0.10.20) дескрипторы есть

(2) вот их и смотри.

(1) Вру, только протокол просмотра задачи, дескриптора на доступ нет

Через дубль обновил контейнер сотрудника

она считается удаленная губанова
но когда через задачу проваливаешься в сотрудника открывается активный контейнер

Исполнители за недействительных сотрудников, осталось понять почему и как он заполнился на действующего сотрудника

Идете в регистр сведений "Дескрипторы для объектов". Там ищете эту задачу, смотрите, к какому дескриптору она относится. Открываете дескриптор и смотрите закладку "Права доступа". нажимаете там кнопку "Обновить", и появляется закладка "Данные для расчета прав". Изучаете, что там будет показано.