Подключаюсь к 1С 8.3 через VPN. Пользователи находятся в другом городе. Как можно обновить платформу?

старую удаляешь, новую ставишь и молишься что бы ключи не слетели

(0) Вид клиента угадает потомственная Ванга? Для тонкого клиента вот такой есть вариант: v8: Автоматическое обновление тонкого клиента 8.3

(1)А зачем старую удалять? Чем она мешает? Просто ставите новую, и все... Стартовать будет последняя, самая свежая, в рамках того, что в параметрах регистрации конфы прописано... Если что-то пойдет не так, то можно будет там указать, какую конкретно платформу запускать, из установленных.

(3) а если там вэб-сервер поднят?

(0) Мало данных. Файловая база? Или клиент-сервер? Сервер нужно обновлять?

По сути, не имеет значения: удаленный клиент или локальный. Ставишь нужный релиз платформы, запускаешься. Проверяешь, что все работает. Что не взлетело - пинаешь, пока не взлетит.

+5 Важное замечание: старые релизы не сносить, пока не убедишься, что на новом релизе все работает без проблем.