Вот думаю как реализовать, можно на базе подарочных серитикатов (но там есть привязка к розничному чеку), а можно написать свою подсистему? Что посоветуете?

Любые сертификаты - зло ибо куда их пихать согласно 54 ФЗ непонятно.