Цель - сопоставить похожие номенклатуры по которым выявлены расхождения, устранить пересорт.
В задаче предполагается, что все излишки и недостачи по итогам инвентаризации перенесены на СлужебныйСклад с целью проведения дальнейшей аналитики.
Интересует как оприходовать отрицательный остаток на СлужебномСкладе?

А в чем проблема? Проверки прикладного кода конфигурации обойди, вот и все

(1) Да, можно конечно. Я думал можно как-то не меняя ничего в конфигурации

(0) Конфа то какая?

(2) Ну не меняй, напиши обработку, которая движения сделает мимо стандартной процедуры.

(2) Это все легко делается внешней обработкой, можно даже подключаемой к твоему документу инвентаризации

(0)  если написано что все излишки и недостачи перенесены на служеьный склад то вопрос как опрходовать отрицательные остаток не может родиться в принципе потому как противоречит первоначальному утверждению

Отклонения на основном складе можно ппросто получить перемещением из или на служебный склад, при таких перемещениях видимо д б отключен контроль остатков

(3) УТ 10.3

(5) Да, уже подумал об этом и пришёл к выводу, что это не так уж важно для моей задачи

"Цель - сопоставить похожие номенклатуры" - вот если решишь это проблему - "сопоставление" - остальное станет делом техники.

PS: на самом деле ничего сложного. Создаешь документ инвентаризации, заполняешь остатками, указываешь фактические данные, на основании инвентаризации получаешь документы оприходования и списания - вот твои списки кандидатов на "сопоставление". Ничего сложного, всё типовое и штатное.

(6) Мне не Основном складе надо получить отрицательные остатки, а на Служебном, чтобы как-то потом идентифицировать что есть излишек, а что недостача. Первоначальное утверждение предполагает, что они туда перенесены, но в моей базе то там ничего нет, поэтому я хотел туда переместить, чтоб отлаживать удобнее было.

"Интересует как оприходовать отрицательный остаток на СлужебномСкладе?" - перемещением из СлужебногоСклада, заполненного отрицательными остатками склада-приёмника (внешняя обработка заполнения ТЧ)

Проводит документ пользователь с правом превышения остатка по складу и организации.

Ну в целом понятно, всем спасибо.

(10)  включаем мозг
На основном складе излишек 10 штук
Делаем
Дт Основной склад Кт Служебный склад 10 шт
Недостача на основном складе - наоборот