В Windows с сайта поддержки скачивается инсталятор внешней компоненты, которая перенаправляет данные со сканера в приложение 1С, для linux нет такой компоненты, наверное как-то средствами ос нужно...
TurboConf — расширение возможностей Конфигуратора 1С