ПланВидовРасчета.ДополнительныеНачисленияОрганизаций.ПриРожденииРебенка

К стандартному понятно, а как созданному пользователем?

Это одна вопрос как или разные?

(1)Насяльника чито не понятно?

В запросе не предопределенные виды расчетов имеют свойство "Предопределенный" равное значению Ложь.

(0) А как Вы к контрагенту в запросе обращаетесь?
Естественно его надо как-то идентифицировать. По коду там, или наименованию, или дать пользователю ссылку выбрать. И еще туча вариантов.

Мне надо в запросе убрать не нужные выплаты, по наименованию находит только предопределенные, коды тут вообще не стоят.

ПланВидовРасчета.ДополнительныеНачисленияОрганизаций.ПриРожденииРебенкаСозданногоПользователем, не? Как вариант, еще: ...НаСервере?

Добавить в план видов расчетов реквизит "НужнаяВыплата" (тип - булево) и в запросе ставить условие:
ГДЕ ВидРасчета.НужнаяВыплата = Истина

(5) "по наименованию находит только предопределенные" - вранье
"коды тут вообще не стоят" - это беда, и поставить их никак.
Но по наименованию или коду не советую.

Я уж было подумал что "Дополнительная премия" будет как  - ПланВидовРасчета.ДополнительныеНачисленияОрганизаций.ДополнительнаяПремия   но такую не понимает, и с СозданногоПользователем не канает))

(8)коды проставлять разбираться минут 20, а правильно написать   20 сек)

Короч, всегда нужен регистр сведений "ВсякиеСоответствия", два измерения и ресурс:
измНазвание, измЛюбаяСсылка = ресЛюбаяСсылка
измНазвание: "Отбор нужных выплат 01"
измЛюбаяСсылка: неопределено;
ресЛюбаяСсылка: НужныйПланВидов

Один раз заполнив - в запросе использовать выборку по Подстрока(измНазвание) = "Отбор нужных выплат"

(11) геморно что-то, пошел коды ставить)

(12) Ох...