Что я делаю не так, переделываю формы у документа в управляемые, но в 1С  в режиме обычного приложения они не отображаются, рядом лежит конфигурация другая с упр формами, там все запускается, в чем проблема ?

укажи их как дополнительные

попробуй изменить параметры запуска в конфигураторе на Толстый клиент (управляемое приложение)

а галочка стоит "Разрешить управляемые формы в обычном приложении"?

а не внешние формы?