в чем может быть проблема?

У меня бывает в ПРФ отчётности не распределяет по уволенным, если они "Перенесены в архив".. попробуй верни из архива и заного сформируй..

(0) Я ценю лаконичность, но тут явный перебор :) Что за "выплаты" после увольнения? Когда и какими документами они были расчитаны и выплачены?

PS: надеюсь ТС "в курсе" письма Минфина РФ от 31 декабря 2010 г. N 03-04-06/6-328? О том, что карточка 1-НДФЛ заменена регистром налогового учета? Что там с выплатами уволенных сотрудников?