Есть ли возможность выгрузить только объекты одной подсистемы и загрузить их в другую конфигурацию?
Может руки кривые... Только объединение конфигураций не позволяет выбрать загружаемые объекты по подсистемам.? Есть возможность выгрузить в файлы. Но для этого в конфигурации-приемнике должны уже существовать такие объекты. Пообъектное копирование может сбивать связи между объектами. Если сначала копировать (например) подчиненный справочник, а потом справочник-владелец.
Короче хочется получить файл конфигурации с объектами одной подсистемы.
(2) т.е. ты хочешь получить cf в котором будет только твоя подсистема, при этом в документе будет реквизит Организация, ссылающийся на объект метаданных Справочники.Организации с определенным UUID , но этого справочника не должно быть в результирующем cf ?
(3) "ри этом в документе будет реквизит Организация, ссылающийся на объект метаданных Справочники.Организации с определенным UUID , но этого справочника не должно быть в результирующем cf?"
Нет. Подсистема касается только работы с файлами, Ворд, Ексель, ком-порты... Никаких других механизмов конфигурации она не касается.